¿Cual es el artículo en MEDLINE con mayor número de autores?

Ya comentaba ayer algunos datos de las estadísticas de MEDLINE que acaban de salir.

Hoy quiero señalar una curiosidad relativa a las estadísticas de autoría:

¿Cual es el artículo de los 21.508.439 existentes que tiene mayor número de autores?

Corresponde a un artículo del año 2010 de la revista Physical Review Letters con PMID 21230962. Aquí os dejo la imagen y, para que no perdáis el tiempo y la vista os adelanto que tiene ¡3.172 autores!. Curiosamente su abstract es de cuatro lineas y de las 19 páginas que ocupa el artículo, el listado de autores comienza en la 5.

PubMed_autoria_21230962

Estadísticas de MEDLINE del año 2012

Como cada año la National Library of Medicine publica las estadísticas de la base de  datos MEDLINE.

Este año me ha llamado la atención que la proporción de registros cuyo país de procedencia de las revistas es Estados Unidos: un 43% de las citas en MEDLINE son de revistas procedentes de EEUU. Sin embargo, en el año 2012 el porcentaje es aún mayor, del 45%. Esto se debe a que con el paso de los años la proporción de revistas procedentes de Estados Unidos ha ido incrementándose desde un 31% en el año 1964.

Por otro lado, el porcentaje de referencias escritas en inglés es del 93% para los años 2010-2012, cuando en el intervalo de años de 1960-1964 era de solo el 49%.

Como vemos, el sesgo a las publicaciones Norteamericanas y al idioma inglés va haciéndose cada año mayor en MEDLINE.

Cómo configurar alertas de revistas de nuestro interés utilizando PubMed

Una de las más interesantes utilidades que encontramos en PubMed es la posibilidad de configurar alertas de correo electrónico de artículos de revistas. De esta forma nos mantenemos al día y actualizados con los artículos de aquellas revistas de nuestra área de interés.

Para ellos es necesario que nos creemos una cuenta personalizada en MyNCBI. Es gratuito y debemos incluir un correo electrónico activo en el que deseemos recibir las alertas.

En el siguiente vídeo de la NLM encontraréis una breve demostración de cómo configurar alertas de correo electrónico para los artículos de un conjunto de revistas utilizando MyNCBI de PubMed.

Cómo recuperar las referencias de un número de una revista

El el siguiente vídeo se indica como recuperar en PubMed las referencias de un número concreto de una revista.

Acordaros que el paso previo para poder visualizar los iconos con los enlaces de acceso al  texto completo de los artículos es necesario entrar en la dirección de PubMed institucional del Hospital de Getafe

Nueva estrategia de revisiones sistemáticas en PubMed

En PubMed disponemos de la búsqueda por el campo “subset” o subconjunto que nos permite limitar nuestra estrategia a temas específicos. Así disponemos de subset de AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary medicine, Dietary Medicine, History of Medicine, Systematic Reviews, Toxicology y Veterinary Science.
En el mes de febrero de 2013 se han revisado en PubMed algunos subset como el subconjunto de revisiones sistemáticas (“Systematic Reviews”). Esta estrategia tiene como objetivo la recuperación de citas identificadas como revisiones sistemáticas, meta-análisis, revisiones de ensayos clínicos, la medicina basada en la evidencia, conferencias de consenso de desarrollo, guías y artículos de revistas especializadas en estudios de revisión de valor para los clínicos.

Podemos aplicar esta estrategia de diferentes maneras:

  • añadiendo el subset o subconjunto “systematic” seguido de la etiqueta [sb]. Por ejemplo: exercise hypertension AND systematic [sb].
  • Aplicando este subset que se encuentra disponible en la barra lateral izquierda de “Filters”.
  • Desde la pantalla de Clinical Queries.

Cuando aplicamos este sunconjunto o subset la estrategia que se ejecuta es la siguiente:

subset systematic PubMed

Búsqueda de la literatura científica (vídeo webinar CCI-OPS)

Aquí os dejo la grabación de un webinario impartido por Ivan Solà de título “Búsquedas de la literatura científica” que se celebró el pasado 11 de octubre de 2012.

Este webinar forma parte del acuerdo entre la Asociación Colaboración Cochrane Iberoamericana-Centro Cochrane Iberoamericano y la organización Panamericana de Salud/ Organización Mundial de la Salud para incentivar la producción de revisiones sistemáticas.

Podéis encontrar las grabaciones de todos los webinarios en: http://cochrane.es/ACUERDO_OPS_CCIB

Vídeo sobre cómo utilizar el MeSH para buscar en PubMed

La búsqueda con el tesauro MeSH es poco utilizada pues requiere un conocimiento avanzado de la base de datos MEDLINE. Sin embargo, es necesaria su utilización cuando queremos hacer una búsqueda precisa.

Os dejo un vídeo de la NLM en el que explica como hacer una búsqueda con los encabezamientos MeSH en PubMed.

PubMed permitirá ver el resumen en lengua no inglesa que incluya el artículo original

La NLM anuncia que en breve los editores tendrán la oportunidad de incluir en PubMed los resúmenes en lengua no inglesa de los artículos. Para ver el resumen en el idioma original dispondremos de un enlace cuando visualicemos el registro del artículo en formato “Abstract”.

PubMed_resumen lengua no inglesa

 

Al cliquear en el enlace del idioma pasaremos a ver el resumen en el idioma diferente del inglés que aparece por defecto. Si un registro sólo dispone de resumen en lengua no inglesa, PubMed no mostrará un resumen por defecto pero podremos seleccionar la opción del idioma no inglés.

Los resumen en lengua no inglesa no estarán disponibles en los formatos de visualización “Summary” (el que aparece por defecto), MEDLINE o XML y no estará disponible para su descarga a través de E-mail utilities. Por otra parte parece que no estarán disponibles estos datos en otros proveedores de MEDLINE.

Más información en: http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf13/jf13_pm_abstract.html

Palabras claves del autor en PubMed

Terminamos la semana con más cambios en PubMed. Para empezar os comento que ya se encuentra activa una novedad anunciada hace unos días que nos permite la descarga del historial de búsqueda como archivo para Excel.

Pero además, ahora tenemos disponibles en el registro las palabras claves que el autor del artículo ha incluido en este.

Para buscar las palabras claves se pueden buscar sin etiqueta o con las etiquetas de otro término [OT] o palabra de texto [TW]. Las palabras claves del autor las visualizamos en los formatos de Abstract, MEDLINE y XML.

Aquí os dejo un pantallazo con un ejemplo de búsqueda con la etiqueta OT.

KeywordsPubMedMás información en: http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf13/jf13_pm_keywords.html

Recomendaciones para la implantación de la Práctica Basada en la Evidencia

En un reciente artículo publicado en BMJ Open (Ubbink DT, Guyatt GH, Vermeulen H. Framework of policy recommendations for implementation of evidence-based practice: a systematic scoping review. BMJ Open. 2013 Jan 24;3(1). doi:pii: e001881. 10.1136/bmjopen-2012-001881. Print 2013. PubMed PMID: 23355664.) se hace una revisión sistemática de la literatura para resumir las soluciones propuestas de infraestructura y organizativas para promover la práctica basada en la evidencia (PBE).

Los autores llegan a la conclusión de que después de más de 20 años de su introducción, el paradigma de la PBE ha sido adoptado por profesionales de la salud como un medio importante para mejorar la calidad de la atención al paciente, pero su aplicación sigue siendo deficiente.

Entre los resultados se encontró que la mayoría (mediana 64%) de los médicos y enfermeras consideraban su conocimiento de la PBE era insuficiente, una media del 70% de los encuestados consideraron que sus habilidades como insuficientes e igual ocurrió con su formación en estos temas.

Aunque  la accesibilidad a PubMed fue alta (al menos el 88%, con alguna excepción) la toma de decisiones clínicas se basaban en libros de texto  y en la consulta a colegas en lugar de mediante la búsqueda en bases de datos electrónicas.

Las barreras se resumen en la siguiente tabla y que fueron sorprendentemente similares excepto la barrera del idioma para los países de habla no inglesa y la limitación en el acceso a bases de datos electrónicas de algunos países:

Barreras PBE

El total de las soluciones recomendadas las podéis consultar en la siguiente tabla (http://bmjopen.bmj.com/content/3/1/e001881/T5.expansion.html) muchas de las cuales se basan en la educación y aprendizaje.

Por mi parte destaco una de las recomendaciones que indican la necesidad de existencia de Servicios de Biblioteca con servicios de búsqueda en las bases de datos, accesos a Internet y ordenadores en el sitio de toma de decisiones, sistemas que permitan el acceso a Guías, protocolos y temas evaluados críticamente (CATs) y sistemas de apoyo a la toma de decisiones automatizada con prioridad de revisiones sistemáticas.

Materiales webinar “PubMed para principiantes”

Como ya os anuncié en mi anterior entrada, ayer por la tarde impartí el webinar en SocialBiblio  de título “Pubmed para principiantes“.

Me alegró ver que acudieron no sólo profesionales de la información y bibliotecarios, sino también muchos profesionales sanitarios que quisieron aprender más sobre esta herramienta de búsqueda especializada en ciencias de la salud.

A todos los que me seguisteis, y por supuesto a Paula y María, me gustaría daros las gracias.

Os dejo la presentación así como el enlace a la grabación de la clase para los que no pudierais asistir en directo.

Webinar “PubMed para principiantes” en SocialBiblio

El próximo miércoles 23 de enero a las 22:00 horas voy a impartir un webinar en SocialBiblio de título: PubMed para principiantes.

Está dirigido a personas con escasos conocimientos de búsqueda en PubMed. Se explicará qué es y su contenido, haremos una presentación de sus características, veremos cómo realizar estrategias de búsqueda básicas y explicaremos cómo interpreta PubMed nuestra estrategia. Por último aprenderemos a limitar nuestros resultados y las diferentes opciones disponibles de visualización y manejo de las referencias recuperadas.

Para participar como alumno a la sesión online solo debes seguir los pasos que encontrarás en este enlace: http://www.socialbiblio.com/participa/participa-como-alumno/

Puedes acceder al aula virtual en WizIQ desde tu table Android o iPad así como desde tu ordenador. 

Como ya la mayoría sabéis SocialBiblio es una comunidad de práctica en línea sobre biblioteconomía, documentación y gestión de la información y cuyo proyecto se debe a mis dos compañeras bibliotecarias Paula Traver y María García-Puente.

Guía de uso para crear alertas en PubMed

La Biblioteca Virtual del Sistema Sanitario Público de Andalucía acaba de publicar una Guía de uso sobre alertas bibliográficas en PubMed que aquí os dejo:

Los que seáis usuarios del Hospital de Getafe deben tener en cuenta que la URL del PubMed de nuestra institución es: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?myncbishare=bibgetafe

pero a partir de la página 5 de la Guía es aplicable a todo aquel que quiera crearse una cuenta en PubMed para posteriormente crearse alertas por correo electrónico.

 

Mejora de My Bibliography en PubMed

My Bibliography va a mejorar incluyendo una opción para generar un informe en formato PDF.

Además, se ha desarrollado un nuevo filtro “Linked to my Awards” en My Bibliography para ayudar a los investigadores a limitar los resultados a las publicaciones directamente relacionadas con sus premios.

myncbi_pdf_fig1

Nos aparecerá una ventana emergente donde podemos completar el encabezado y el pie de página del informe introduciendo el nombre y apellidos, así como un número de página inicial para el informe. Estos campos se pueden dejar en blanco si desea introducir la información manualmente.

myncbi_pdf_fig2

El PDF resultante tendrá la información introducida en los campos de Nombre, segundo nombre y apellido en la esquina superior derecha de todas las páginas incluidas en el informe.

myncbi_pdf_fig3

Información obtenida del NLM Technical Bulletin nº 389 de noviembre-diciembre 2012.

 

 

 

 

Filtro de búsqueda en PubMed para la identificación de estudios pediátricos

Acabo de leer el artículo del Cochrane Childhood Cancer Group publicado en la revista Journal of Pediatrics cuyo objetivo es el identificar y validar los filtros de búsqueda en PubMed para la recuperación de estudios en niños y desarrollar un nuevo filtro de búsqueda pediátrico para PubMed.
Además del límite de PubMed “All Child: 0-18 años”, ahora renombrado filtro, los autores identifican 6 filtros de búsqueda para la recuperación de los estudios en niños.
Sin embargo, los autores concluyen que los filtros de búsqueda identificados o bien tienen una baja sensibilidad o una baja precisión con un NNR (number need to read) alta.
Con estos datos, los autores han desarrollado un nuevo filtro de búsqueda con una óptima sensibilidad (99,5%) y la precisión (69,0%) y bajo NNR.
El filtro es el siguiente:

Infan* OR newborn* OR new-born* OR perinat* OR neonat* OR baby OR baby* OR babies OR toddler* OR minors OR minors* OR boy OR boys OR boyfriend OR boyhood OR girl* OR kid OR kids OR child OR child* OR children* OR schoolchild* OR schoolchild OR school child[tiab] OR school child*[tiab] OR adolescen* OR juvenil* OR youth* OR teen* OR under*age* OR pubescen* OR pediatrics[mh] OR pediatric* OR paediatric* OR peadiatric* OR school[tiab] OR school*[tiab] OR prematur* OR preterm*

Donde mh es Medical Subject Heading y tiab title or abstract.

La referencia completa es: Leclercq E, Leeflang MM, van Dalen EC, Kremer LC. Validation of Search Filters for Identifying Pediatric Studies in PubMed. J Pediatr. 2012 Oct 17. doi:pii: S0022-3476(12)01026-8. 10.1016/j.jpeds.2012.09.012. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 23084708.

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